# 六条正式轨迹的证据评述 --- 针对这六条正式 v2 轨迹索引所有 495 轮与 1,669 条动作，复查公开过程说明、关键命令、原生表内容、评分及诊断，并抽查关键/最后画面。未逐帧观看全部录像；不声称获得不可见的内部推理。未重新运行模型，也未修补原始提交或改写评分。 --- # Clovane 结构修订 原生文件尚未成立，恢复操作又终止了整个显示服务 模型尝试把结构变换、最短路径和立体化学审计写入同一张原生图，但生成的 XML 根标签不配对。后续没有修复文件，而是反复尝试打开与恢复界面，最终发送 Terminate_Server，连同桌面和录屏一起中止。0 分首先反映原生交付无效，不能据此断言每项化学推理都错。 分数：0；最终通过：false；轮数：47；动作：150。 停止原因：T047 / A150 的 Terminate_Server 导致 X 连接断开；没有最终答复。47 / 100 轮，未耗尽步数。 ## 完成质量 ### 文件格式先于科学评分失败 收集到 104,675 字节的 revision.xdc，但独立格式诊断发现第 1144 行标签不匹配：开头是 xdrawchem，结尾却是 XDC。评分器的 24 项未通过均带有同一条“Not a complete XDrawChem document”；这是前置门失败，后续科学内容未建立。 证据性质：直接证据；轮次：29, 32；文件：evaluation.json, recovery/submission-format-diagnostic.json, submission/output/revision.xdc。 ### 最后画面仍是 starter，不能视为输出已重开 最后可用截图 T046 的标题仍指向 input/revision_start.xdc，画面保留未完成的 R 与决策占位。output 文件存在和图已在原生应用中成功打开，是两件不同的事。 证据性质：直接证据；轮次：35, 46；文件：episode.json。 ## 操作细节 ### 先抽取图，再生成三份分子与记录区 T018 用正则读取原子、坐标和键；T029 用 BFS 枚举两个候选位点到三个观测位点的路径，并用 RDKit 计算三个状态的式量、图计数和手性中心，再拼装 S/P/R、箭头与文本。操作体现了从原始图组织审计的意图。 证据性质：直接证据；轮次：18, 29；文件：对应动作与截图。 ### 局部补丁没有覆盖最外层格式 T032 修复 arrow/text 标签带属性时的正则匹配，T034 修改氧元素显示掩码；这些补丁处理了局部格式，却没有加入完整 XML 解析或原生加载成功检查。 证据性质：直接证据；轮次：32, 34, 38；文件：对应动作与截图。 ## 停止与阻碍 ### 直接中断来自模型可见动作 T046 发送 Ctrl+Alt+BackSpace，T047 / A150 发送 Terminate_Server；动作返回 X connection to :0 broken。此后无法再采集桌面。最初 runner 的 scrot 错误是显示服务退出后的结果，现有证据支持把它归为模型操作造成的中断。 证据性质：直接证据；轮次：46, 47；文件：actions.jsonl, recovery/failure-classification.json。 ### 录像恢复只保住真实前缀 恢复流程收回原生文件并保留 713.5 秒、21,405 帧的录像前缀，没有恢复模型继续解题。T047 没有动作后截图，也没有最终采集画面；网页保留这一缺口。 证据性质：直接证据；轮次：后置评分/原生文件；文件：recording/manifest.json, recovery/recorded-prefix-verification.json。 ## 能力缺陷 ### 缺少最小成本的交付预检 在大规模拼接原生文档之前，没有先验证“读入 starter → 写回 → XML 解析 → 原生重开”的小闭环。根标签错误本可以在科学内容和排版扩张前被定位。此处暴露的是格式契约与分层诊断能力不足。 证据性质：证据支持的解释；轮次：29, 32, 35；文件：对应动作与截图。 ### 恢复动作的影响范围失控 遇到应用未按预期打开时，模型把恢复扩大到了整个 X 服务。安全的下一步应先界定文件、应用进程和显示服务三个层级；本轨迹没有完成这种隔离。 证据性质：证据支持的解释；轮次：38, 46, 47；文件：对应动作与截图。 ## 非直觉发现 ### 终端错误并不自动等于算力或 E2B 失效 T016 的 ctrl+- 是工具不能解析的按键序列；后面的 X 断连则有明确的终止动作。两种错误的来源不同，不能统一归为基础设施故障。 证据性质：直接证据；轮次：16, 47；文件：actions.jsonl。 ### “全部科学项未通过”不等于 24 个独立科学错误 评分没有读到有效文档，因而未建立分子结构、路径、立体和可见科学记录。应把证据结论限定为交付失败，而不是把同一个格式错误重复解释成很多能力失败。 证据性质：证据支持的解释；轮次：后置评分/原生文件；文件：evaluation.json。 ## 非平凡思路 ### 把图论路径和化学局部审计放在同一产物 BFS 路径、图连通性、分子式和立体中心可以形成互相核对的不同证据层。T029 已搭出这条思路，但没有把计算结果可靠落入可重开的原生图。 证据性质：证据支持的解释；轮次：29；文件：对应动作与截图。 ### 三个状态复用同一份源图 从同一原始 molecule 派生 S/P/R，并局部改变指定键级和元素显示，有利于保持其余身份信息一致。值得保留的是源图复用策略；当前串接 XML 的实现不足以保证原生正确性。 证据性质：证据支持的解释；轮次：29, 34；文件：对应动作与截图。 --- # Heisenberg 本征子空间延拓 科学分析有明确结构，但 helper 表重复了原始表的完整识别头 模型区分残差、Gram 误差、投影子距离和分支延拓，并交付 ODS 与可编辑 SVG。评分在发现 parameters 逻辑表时提前终止：原始 parameters 和新增 RunJoin 都包含完整识别头。现有证据支持“原生表发现歧义”，尚不支持把 C0/C1 的全部数值结论判为正确或错误。 分数：0；最终通过：false；轮数：87；动作：218。 停止原因：T087 主动给出最终答复；87 / 500 轮。无运行阻塞，失败发生在独立评分读取工作簿时。 ## 完成质量 ### 两个产物存在，科学门没有继续执行 提交 analysis.ods 和 figure.svg，模型声明均已重开。独立评分为 0，唯一具体 native_check 是 Duplicate or ambiguous logical table parameters；其余门的 false 应理解为未建立，不是逐项已经证伪。 证据性质：直接证据；轮次：76, 87；文件：evaluation.json, submission/output/analysis.ods, submission/output/figure.svg。 ### 可把歧义定位到实际保存的表头 原生 XML 中 parameters 和 RunJoin 都具有 run_id、condition、g、delta。评分器按识别头找逻辑表，除特定向量表外不按首选表名消歧；两者因而成为候选。指令允许 helper，但明确要求不要让逻辑表出现歧义。 证据性质：直接证据；轮次：35；文件：review/native-headers.json, review/checker-table-discovery.txt, task-public.json。 ## 操作细节 ### 先按 ID 构造数值证据链 T027 独立计算重叠匹配分数、投影距离、密集谱间隙和 repeat 候选的残差；T035 用 INDEX/MATCH、组合键与组件表把这些量接回原始证据，避免依靠行序碰巧相同。 证据性质：直接证据；轮次：27, 35；文件：对应动作与截图。 ### 后半程集中处理图表与矢量可见性 T058–T059 修正原生 XY 序列，使数值 g 和延拓能量作为实际数据源；T061 后生成直线段 SVG，T077–T084 在 Inkscape 打开并调整对象属性。T086 的检查还统计路径节点与样式。 证据性质：直接证据；轮次：58, 59, 61, 77, 84, 86；文件：对应动作与截图。 ## 停止与阻碍 ### 并未“无法继续”，而是过早结束验收 模型在仍有步数时宣布 Nothing remains incomplete。真正的阻塞发生在后置评分：工作簿读取还没进入数值与图形门，就因逻辑表不唯一停止。不能把这个结果写成超时或算不出本征值。 证据性质：直接证据；轮次：87；文件：episode.json, evaluation.json。 ### 前期存在输入通道适配成本 前二十余轮多次读取同一合同和 CSV 头，T013 使用 stty sane 并关闭 bracketed-paste。动作记录与终端画面支持输入适配问题；仅凭重复文本，不能把这些轮次全算作科学推理停滞。 证据性质：直接证据；轮次：1, 13, 23, 26；文件：actions.jsonl。 ## 能力缺陷 ### 自检覆盖了计算，却没覆盖原生消费者的发现规则 模型测试了公式、扰动和重开，却没有检查新增 helper 是否会被当成第二份权威表。最终能被自己脚本读懂，与能被独立读取器唯一识别之间存在缺口。 证据性质：证据支持的解释；轮次：35, 76, 86；文件：对应动作与截图。 ### 完成声明强于已建立的证据 C0 crossing、C1 gap certificate 与 T2 residual failure 是模型给出的结论；独立评分尚未到达这些门。评述保留这些有价值的分析线索，同时不把模型自检视为最终通过证明。 证据性质：证据支持的解释；轮次：42, 87；文件：evaluation.json。 ## 非直觉发现 ### 接近正交的向量仍可能不是本征向量 T027/T042 明确区分 Gram 检查与 Hψ−Eψ 残差：T2 的基几乎正交，仍被模型自己的残差检验拒绝。这个诊断维度的分离有实际价值，但其数值尚未由该次独立评分认证。 证据性质：直接证据；轮次：27, 42；文件：对应动作与截图。 ### 分支身份不能直接沿用能量排序 模型通过重叠匹配给出 C0 的 rank swap，并把 g=0.500 的簇与两侧 0.490/0.505 区分开。在近简并处追踪子空间、在离簇处追踪单向量，是比逐点排序更合适的分析策略。 证据性质：证据支持的解释；轮次：27, 42；文件：对应动作与截图。 ## 非平凡思路 ### 把局部证书、桥接边和全区间审计联合起来 残差/Gram 负责候选有效性，overlap 匹配负责跨步延拓，dense audit 与下界负责区分交叉和正间隙。模型确实编写了不同表来承载这些约束，避免单张平滑曲线承担全部论证。 证据性质：证据支持的解释；轮次：27, 35, 42；文件：对应动作与截图。 ### 用公式驱动图坐标，减少图与表漂移 FigureMap、MarkerCoordinates 和 SVG 分支锚点形成计算到绘图的映射；T076 还报告了能量、重叠和 repeat-action 扰动传播。该设计值得保留，但应先解决 helper 表与权威表的识别冲突。 证据性质：证据支持的解释；轮次：59, 61, 76；文件：对应动作与截图。 --- # Heilonine 反应原子守恒 已有九项肯定证据，最终分数被图轴检查能力阻塞 模型完成可编辑守恒账本、路线反例和两组分子比较，并进行较系统的输入扰动与原生重开检查。独立评分已有九项通过，但无法将提交图表的坐标轴匹配到校准参考，明确返回 environment_error。分数必须保留 null；已通过项可确认，剩余分子场景与可见内容尚未认证。 分数：null（评分环境阻塞）；最终通过：false；轮数：74；动作：279。 停止原因：T074 主动最终答复，74 / 500 轮。模型正常结束；未完成的是后置评分，非求解器卡死。 ## 完成质量 ### 科学结果中有已经通过的部分 artifact_loading、raw_scientific_inputs、inventory、route_rules_and_witnesses、stereochemistry、cross_artifact_table、editable_chart、disclosed_input_variations、redundant_scientific_claims 九项为 true。这比仅有模型完成声明强，但不代表余下两项已经通过。 证据性质：直接证据；轮次：后置评分/原生文件；文件：evaluation.json。 ### 最终结论只能是未评分 native_molecules_selections_measurements_scenes 和 visible_workbook_content 被标为 Not evaluated。阻塞错误是 chart-axis layout cannot be matched to its calibrated reference，score=null。不能将其算成 0，也不能按九项通过外推为满分。 证据性质：直接证据；轮次：后置评分/原生文件；文件：evaluation.json, run/grading-limitation.json。 ## 操作细节 ### 分别核对原子账、路线接头和远端构型 模型读取网络边、显式原子和有序邻居行列式，构造 Ledger、Stereo、Decisions、NativeChecks。其说明区分了 P6 的节点接头错误、P5 的同位素位置错误，以及 P3 的端点构型问题，避免只按总质量判断。 证据性质：直接证据；轮次：23, 32, 38；文件：对应动作与截图。 ### 自检确实包含变化后的依赖传播 T057 起对质量常数、原子归属、坐标反射与缩放、路线边 ID 和图表数据进行临时扰动；T064–T067 又核对 PSE 的元素、坐标、键、选择集与场景启用对象。T054 已报告重开场景的 3.648 Å / 2.892 Å 距离核对。 证据性质：直接证据；轮次：54, 57, 64, 67；文件：对应动作与截图。 ## 停止与阻碍 ### 依赖修复后仍停在图轴能力边界 最初缺 pdftotext，补齐 poppler-utils 后仍多次遇到相同图轴校准错误。诊断记录和评分器能力说明把这一情形定义为 inspection limitation；原始提交和科学 evaluator 都没有被改写。 证据性质：直接证据；轮次：后置评分/原生文件；文件：run/grading-limitation.json, review/chart-axis-capability.txt。 ### 作者基线通过不等于模型提交通过 同一依赖环境下，作者正例得到 1.0；它证明该环境能评价受支持的原生布局，不能证明当前提交的图轴正确。这个对照不属于模型 trajectory，也不计入模型分数。 证据性质：直接证据；轮次：后置评分/原生文件；文件：run/grading-limitation.json。 ## 能力缺陷 ### 本次无法从阻塞结果推断剩余科学缺陷 未评分的分子场景与工作簿可见性仍存在验证空白；没有证据时不填“能力不足”结论。能够指出的局限是：模型自检没有涵盖独立检查器的图轴可观察性，最终的完全完成声明缺乏这层确认。 证据性质：证据支持的解释；轮次：74；文件：evaluation.json。 ### 通用验证脚本仍多次猜错输入字段 T059–T067 把 node_id/iso_key、图键表达和 phase 条件逐次修正，说明读取源 schema 不够一次到位。它增加了动作与上下文开销；最终九项通过也表明这些早期错误不能直接当成最终科学错误。 证据性质：证据支持的解释；轮次：59, 62, 65, 66, 67；文件：对应动作与截图。 ## 非直觉发现 ### 总质量守恒不保证同位素位置守恒 模型把 P5 中 A21 失去 13C、另一位置增加 13C 的情形作为反例：总计可能不变，映射身份却不守恒。独立路线与账本门已通过，支持该分层审计方向。 证据性质：直接证据；轮次：38, 68；文件：evaluation.json。 ### 距离是状态见证，不能单独证明手性 模型明确把 A23–A26 距离作为对象/状态核对，把有序邻居行列式用于局部构型。这种证据职责的区分，避免将一个易展示的距离误当成立体化学证明。 证据性质：证据支持的解释；轮次：38, 54；文件：对应动作与截图。 ## 非平凡思路 ### 为每类错误保留最小反例 路线接头、同位素守恒、键级/储库模式和构型约束分别给出首个失败位置，并把通过路线与等质量反例做成原生场景，便于评审追溯结论。 证据性质：证据支持的解释；轮次：32, 38；文件：evaluation.json。 ### 让错误输入“驱动”公式，检验链条而非静态截图 改变原子质量、归属、坐标和路线键，检查账本与图表是否跟随变化，测试的是依赖关系。相比保存一张看似正确的表，这种验证能暴露常数替代公式与错误连接。 证据性质：证据支持的解释；轮次：57, 68；文件：evaluation.json。 --- # RNA 虚拟酶切可辨识性 复杂枚举与精致场景建立在漏掉固定 18 Da 的质量公式上 模型理解了单片段观测、集合交叠、逐对覆盖和非传递歧义，构建了 448 个子集的公式分析及三套 RNA 场景。但 Fragments 质量公式漏掉了定义中的 18 Da，自编验证脚本又重复这个遗漏；评分还发现数值输入与 scope 类型不符。漂亮的 native 输出没有弥补源模型定义偏差。 分数：0；最终通过：false；轮数：88；动作：240。 停止原因：T088 主动最终答复，88 / 500 轮。无资源耗尽；科学与类型契约错误留到了交付。 ## 完成质量 ### 有直接的科学数值反例 评分指出片段 (3, A, 5, 0) 的 mass_Da 应为 3717，提交为 3699，正好相差 18。T026 的 Fragments.M 公式仅 SUMIFS，未加模型定义的固定 18 Da。此处是公式定义错误，不是显示小数或浮点容差。 证据性质：直接证据；轮次：26；文件：evaluation.json, review/rna-mass-definition.txt, submission/output/analysis.ods。 ### 其他失败需保持各自证据边界 评分还报告 Expected numeric scientific cell 与 Unsupported scientific scope observation_model；多个下游门因前置失败而未建立。当前材料不足以把数值类型错误定位到某个单元格，也不能因此声称全部场景几何错误。 证据性质：直接证据；轮次：后置评分/原生文件；文件：evaluation.json, review/native-headers.json。 ## 操作细节 ### 把识别问题展开为公式依赖链 T026 从可编辑 Bases 计算切点、区间、长度、碱基计数、质量、观测 bin、集合交叠，再计算 Coverage 和 448 个 Subsets；T032 枚举 R2 每条残余边在每个 assay 下的碰撞见证。 证据性质：直接证据；轮次：26, 32；文件：对应动作与截图。 ### 完成跨应用的四行、三脚手架见证 T037–T049 为四种候选/切割见证映射三套 RNA scaffold，建立整残基选集、O3′/P 端点和距离对象；后续把十二个距离回填 Calc，并检查原生 chart 来源 Coverage!A1:D7。 证据性质：直接证据；轮次：37, 40, 49, 60, 66；文件：对应动作与截图。 ## 停止与阻碍 ### 并没有遇到继续推理的硬阻塞 T088 主动交付并声称没有未完成内容。问题在于验收没有回到原始定义，模型直到最终仍认为质量是“additive, without end corrections”，把漏掉常数的解释写进了 Readme。 证据性质：直接证据；轮次：53, 77, 88；文件：final-answer.txt。 ### 前期阅读和粘贴效率低，但不足以解释最终错误 前二十余轮反复查看相同 model/contract 文本；终端粘贴和只读工作簿也消耗了一些动作。后续已正常生成并自检公式，因此不能把最终 18 Da 遗漏归咎于环境始终不可用。 证据性质：证据支持的解释；轮次：1, 14, 22, 29；文件：对应动作与截图。 ## 能力缺陷 ### 所谓独立自检与实现共享了错误假设 T056 的 Python 对照同样使用 sum(ma[x] for x in frag)，没有 +18。于是工作簿与验证代码互相一致，却一起偏离任务定义。这是验证设计中缺乏独立来源锚点的具体例子。 证据性质：证据支持的解释；轮次：26, 56；文件：对应动作与截图。 ### 强项在组合结构，弱项在基础常数与类型契约 模型能组织大量依赖表、非传递碰撞和场景，但没有先拿一个原始片段手算质量核对定义，也未完成 scope 的允许值和数值单元格类型检查。增加验证规模并没有覆盖最基本的语义假设。 证据性质：证据支持的解释；轮次：26, 56, 88；文件：evaluation.json。 ## 非直觉发现 ### 歧义图不应被取传递闭包 模型保留 3–6 与 6–7 的残余边，同时不把 3–7 判为残余边。集合之间“存在共同观测”不具传递性，这个抽象理解是轨迹中的亮点；具体最优面板仍受错误质量公式影响，不能按本次评分认证。 证据性质：证据支持的解释；轮次：32, 34；文件：对应动作与截图。 ### 一个常数可能藏过大量传播测试 18 Da 对所有片段平移，但离散 bin 由 floor(M/d) 决定，边界处会改变结果。扰动质量、成本、分辨率能证明公式在动，不能证明初始公式符合定义。 证据性质：证据支持的解释；轮次：26, 56；文件：evaluation.json。 ## 非平凡思路 ### 把最坏情形识别化成逐对覆盖 用每个 assay 是否使两个候选的全部可行观测集合不相交，作为三条候选对边的覆盖条件；再枚举成本最小面板。这比把一次观测误当全谱更贴合题目的最坏情形目标。 证据性质：证据支持的解释；轮次：26, 32；文件：对应动作与截图。 ### 用粗碰撞与细分离展示分辨率价值 同一对候选保留粗质量 bin 相同、细 bin 不同的片段，再与 3′ 最长允许片段的端点约定并列展示，思路清楚。但它是由当前计算选出的见证，基础公式修复后应重新验证。 证据性质：证据支持的解释；轮次：37, 40, 74；文件：对应动作与截图。 --- # Heilonine Molfile 立体修复 几何审计做得很细，表头和决策枚举却没有遵守公开契约 模型尝试按权威账本筛选有限修复候选，对 R05 拒绝发布，并构建坐标、行列式、距离、发布文件与七个场景。独立评分首先因 StereoAudit 的十二个坐标表头缺少下划线而无法发现表格。复查保存文件还发现 decision 使用自造枚举；即使修正表头，也不能假定其余门会自动通过。 分数：0；最终通过：false；轮数：110；动作：417。 停止原因：T110 主动最终答复，110 / 500 轮。417 条动作，是本批最多；未耗尽步数。 ## 完成质量 ### 实际评分首先停在表头识别 StereoAudit 要求 n1_x_A 等十二个坐标头，模型 T041 生成 n1x_A 等名字。保存的 ODS 仍保持这一拼法，评分器精确匹配后得到 found 0。几何公式、发布物和场景的门因此尚未建立。 证据性质：直接证据；轮次：41；文件：evaluation.json, review/native-headers.json, review/stereo-required-contract.txt。 ### 另一个独立可见问题是决策类型 Decisions 保存 ACCEPT、COLLISION_ONLY、MIRROR_ONLY、ABSTAIN_CONFLICT、MIXED、LOCAL_STEREO_ONLY；公开合同要求 KEEP、REPAIR_GEOMETRY、RECONCILE_STEREO、REPAIR_BOTH、ABSTAIN。它们是语义相近的自造标签，仍不满足明确枚举。该问题由复查发现，尚非原评分实际执行到的失败。 证据性质：直接证据；轮次：43, 54；文件：review/native-headers.json, review/stereo-required-contract.txt。 ## 操作细节 ### 将几何异常和证据权威分开处理 T033 从坐标算有序邻居行列式和 sentinel 距离，并枚举每个 proposal 对每份 ledger 的满足情况；T059 指出 R05 两份 authoritative 账本在中心 2 冲突，不发布 R05。保留六个 release 文件的做法与其拒绝策略一致。 证据性质：直接证据；轮次：33, 59；文件：final-answer.txt。 ### 投入大量原生见证和边界自检 T062 起构建 original/release/comparison 三角色布局及七个场景；T085 报告坐标扰动、选中对象替换、行序反转和 0.10 Å / ±0.20 ų 边界检查。末段又多次重开 ODS/PSE、调整表格宽度与换行。 证据性质：直接证据；轮次：62, 85, 95, 100, 102；文件：对应动作与截图。 ## 停止与阻碍 ### 不是修复候选搜索无解 模型主动完成了六个发布并对一个记录 abstain；停止来自最终答复。评分读取不到必需表头才是本次已证实的阻塞，不能写成“化学修复能力为零”。 证据性质：直接证据；轮次：59, 110；文件：evaluation.json。 ### 只读 starter 与粘贴模式确有额外成本 前 32 轮反复读取合同并处理终端模式；T049/T050 为原生 ODS 加载和只读权限继续修补。它们影响效率，但后面正常保存的表头和枚举偏差属于模型自己输出的契约问题。 证据性质：证据支持的解释；轮次：22, 26, 49, 50；文件：对应动作与截图。 ## 能力缺陷 ### 把语义正确误当成接口等价 n1x_A 与 n1_x_A 对人容易理解，枚举标签也能猜出含义；任务却明确要求语义头和有限枚举。模型没有把这类离散字符串当作与坐标值一样需要逐项验收的科学接口。 证据性质：证据支持的解释；轮次：41, 43；文件：task-public.json。 ### 自检重放没有检验真正交付给下游的 schema 模型按固定列号读取自己的审计表，因此跳过了头部发现与枚举检查；大量数值 replay 能通过，仍无法保证独立读取器能进入相同计算。后半段排版投入没有消除这个缺口。 证据性质：证据支持的解释；轮次：85, 102, 110；文件：对应动作与截图。 ## 非直觉发现 ### 保守拒绝可以是完成任务的一部分 当两份同等权威的 ledger 冲突，选择更顺眼的 proposal 或按多数投票都无法建立安全发布。模型明确提出 R05 abstain，体现了按证据边界停止的正确思路；这与最终文件是否满足契约要分别评价。 证据性质：证据支持的解释；轮次：33, 59；文件：对应动作与截图。 ### 镜像、碰撞与局部错误属于不同信息层 模型没有把所有记录归一到同一几何，而是区分 R03 镜像、R06 sentinel 碰撞兼中心错误、R05 权威冲突。这样的分类比仅比较 RMSD 更接近题目的“最小安全修复”。 证据性质：证据支持的解释；轮次：33, 59；文件：对应动作与截图。 ## 非平凡思路 ### 在有限候选池里求满足全部权威约束的对象 将每个对象对每份 ledger 的不匹配中心数与碰撞标志组合，可以给出可审计的选择/拒绝理由，避免自由优化坐标后凭外观宣布修复。 证据性质：证据支持的解释；轮次：33, 43；文件：对应动作与截图。 ### 同时保留原始、发布和对照三种角色 每条记录的场景除了 before/after，还包含有辨别力的 contrast，并与工作簿中的见证中心和数值关联。这种三角色设计有解释价值；本次仍需独立 native gate 才能认证其准确性。 证据性质：证据支持的解释；轮次：62, 85；文件：evaluation.json。 --- # Clovane 同位素片段设计 枚举、最优性与依赖传播获认证，P 评审角色映射留下一处缺口 这是六条里完成质量最高的一条。256 个候选全部一致，最优性、改造可行性、原生图身份和输入扰动均通过，得分 0.98。唯一失败门是 review_consistency，部分值 0.75；保存的 ReviewMap 将 P_review 关联到 P-upgrade，而角色定义要求 P-original，解释了为何科学结论正确仍没有全通过。 分数：0.98；最终通过：false；轮数：89；动作：365。 停止原因：T089 主动最终答复，89 / 500 轮。后续录像传输恢复属采集流程，未恢复模型求解。 ## 完成质量 ### 核心科学结果有独立完整支持 inventory、enumeration、optimality、retrofit、editable_dependencies、native_identity 六门全通过：256/256 候选匹配，13/13 原生选集准确。名义最优 A8/A12/A14 成本 3；粗分辨率最优 A12/A13/A14/A16/A18 成本 7；P 的 64 个允许超集均不可行，Q 最小新增成本为 4。 证据性质：直接证据；轮次：89；文件：evaluation.json。 ### 0.98 并不等于全部门通过 review_consistency 为 false、fraction=0.75，所以 passed=false。ReviewMap 中 P_review 使用 P-upgrade；评分器的该角色要求 P-original，遇到 case 不符即将该场景判失败。这一直接证据与四场景三份有效的部分值一致。不能据此排除 P 场景还存在其他未执行到的问题。 证据性质：直接证据；轮次：36, 57, 82；文件：review/native-headers.json, review/isotope-review-role.txt, evaluation.json。 ## 操作细节 ### 发现并改正了早期提案转录错误 T034–T036 先建立枚举与工作簿；T041–T044 查回 Proposals 与原始协议，将 P 修正为 A9/A18（mask 66），Q 修正为 A12/A16（mask 36），并重建相关依赖。独立 retrofit 门通过，表明该纠正落实到了提交。 证据性质：直接证据；轮次：35, 41, 43, 44；文件：evaluation.json。 ### 做了细致的可读性和可编辑性检查 T057–T070 在 PyMOL 区分片段独有/共有部分和同位素位置，调整标签、保存场景并重开；T078 后检查质量、成本、bound、源表行序和 retained-H 变化；T084 再重开 ODS，保留真正关联的图表。 证据性质：直接证据；轮次：57, 65, 70, 78, 84；文件：对应动作与截图。 ## 停止与阻碍 ### 没有运行层硬阻塞，缺口留在角色语义 模型正常最终交付，核心科学门均通过。剩余缺口是“这个场景在审查哪一种方案”的映射，而非算不出最佳设计或图形不可读取。 证据性质：直接证据；轮次：89；文件：episode.json, evaluation.json。 ### 录像导出恢复不属于模型行为 episode 记有 checkpoint worker 仍下载而保留沙箱、随后恢复传输；完整录像最终校验通过。网页将 solver 时长与含恢复的总时长分开，避免把后续空闲和下载时间算成模型思考。 证据性质：直接证据；轮次：后置评分/原生文件；文件：episode.json, recording/manifest.json。 ## 能力缺陷 ### 细节 QA 对照了自己的映射，未对照角色定义 T082 的场景 QA 沿用 P-upgrade 这个设定，所以能检查选集和外观，却检测不到角色 case 错误。该遗漏是验证参照不独立，而非缺少测试数量。 证据性质：证据支持的解释；轮次：57, 82；文件：review/isotope-review-role.txt。 ### 最终“全部完成”略强于实际交付 0.98 支持高完成质量，也明确留下必需评审门。需要修的是角色映射及相应场景复验；本评述不修改原始 PSE/ODS，也不把修复设想换算成新分数。 证据性质：证据支持的解释；轮次：89；文件：evaluation.json。 ## 非直觉发现 ### 更多标记不保证方案可升级 不可撤回的 P 位点约束下，全部 64 个超集仍没有粗分辨率可行解，最好 margin 约 −0.496645165 Da；Q 可以添加三个位置达到目标。既有投入可能锁住设计空间，不能凭“多加几个标签”推断可行性。 证据性质：直接证据；轮次：44, 89；文件：evaluation.json。 ### 名义分辨率的最优设计不必是粗分辨率最优 独立结果给出名义多组并列最低成本，而粗分辨率只有 mask 124 可行。分辨率约束会改变可行集合，而不只是给同一最优解加一点安全余量。 证据性质：直接证据；轮次：35, 44；文件：evaluation.json。 ## 非平凡思路 ### 用穷举同时给出最优性与不可能性证书 八个位点只有 2⁸=256 种设计；对每个设计计算六对假设在两个通道的间隔，再检查固定提案超集，能够精确证明最优成本和 P 不可行。独立枚举、最优性与 retrofit 门均已认证。 证据性质：直接证据；轮次：35, 44；文件：evaluation.json。 ### 把限制性对与通道落到原子级见证 不仅报告一个 minimum gap，还保留具体 hypothesis pair、X/Y channel、fragment_i/j 与原子标签，把数值瓶颈接回原生结构。P 的角色映射错误说明，这条证据链的语义键也必须像数值一样验证。 证据性质：证据支持的解释；轮次：36, 57, 82；文件：evaluation.json。